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No local onde hoje se encontra a cidade, havia uma chapada revestida de árvores, com predominância de sambaíba. Daí a origem do topônimo.
Em abril de 1923, João Graciliano Dutra e Bernardo Pereira de Arruda, acompanhados de 16 famílias, localizaram-se próximo ao rio das Balsas, com a finalidade de armar um estaleiro para construção naval. Até então, havia alí um pequeno aglomerado, composto de sete casas, vivendo seus habitantes da caça e pesca.
Após a inauguração do estaleiro, a povoação tomou certo impulso passando a despertar certo interesse das autoridades, que para ali mandara uma agência arrecadadora da prefeitura e coletoria.
Distrito criado com a denominação de Sambaíba, pela lei estadual nº 272, de 31/12/1948, subordinado ao município de São Raimundo das Mangabeiras.
Em divisão territorial datada de 1-7-1950, o distrito de figura no município de São Raimundo das Mangabeiras.
Elevado à categoria de município com a denominação de Sambaiba, pela Lei Estadual nº 1.013, de 31 de outubro de 1953, desmembrado de São Raimundo das Mangabeiras. Sede no distrito de Sambaíba ex-povoado. Constituído do distrito sede. Instalado em 1º de janeiro de 1954.
Em divisão territorial datada de 1-7-1960, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2005.
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Hino Municipal
Sambaíba acordaste para a vida.
Do Maranhão a cidade mais querida.
Tua gente alegre, hospitaleira.
Paisagem atraente e brasileira.
És banhada pelo grande Rio Balsas.
Cristalino, deslizando noite e dia.
Suas águas lembram majestosa fita,
Que lhe serve na mais doce harmonia.
Nós te saudamos de coração.
E mais um aperto de mão.
Verdes campos acolhendo os rebanhos.
Teu lindo céu matizado de azul.
O teu povo enobrece os estranhos.
Premiando tanto o Norte como o Sul.
As montanhas dão um grande colorido,
Refletindo um postal, uma pintura.
O que chega sente-se um escolhido.
Dando graças pela feliz aventura.
Nós te saudamos de coração.
E mais um aperto de mão.
Uma prece ao nosso Criador.
Arquiteto desta obra incomparável.
Todos nós lhe queremos com ardor.
Nos deu vida e Pai adorável.
Tua bênção é a nossa esperança.
A bandeira que nos mantém de pé.
Dai-nos paz, com saúde e bonança.
Te pedimos com toda nossa fé.
Nós te saudamos de coração.
E mais um aperto de mão.